Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHF12Q96QT6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHF12Q96QT6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms