Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARXQ96QS3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARXQ96QS3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms