Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CIB3Q96Q77 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms