Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C2orf48Q96LS8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms