Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX22Q96L94 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms