Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP47Q96K76 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms