Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDLIM2Q96JY6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDLIM2Q96JY6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms