Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC41A2Q96JW4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms