Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms