Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC136Q96JN2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC136Q96JN2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms