Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC11Q96J66 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCC11Q96J66 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms