Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LIN37Q96GY3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms