Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms