Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms