Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC102AQ96A19 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC102AQ96A19 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms