Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX21Q969T3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms