Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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TRIM63Q969Q1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TRIM63Q969Q1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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