Protein–RNA interactions for Protein: Q969H4

CNKSR1, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1Q969H4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNKSR1Q969H4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNKSR1Q969H4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms