Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD50Q92878 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms