Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HERVK_113Q902F9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HERVK_113Q902F9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms