Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATRIPQ8WXE1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms