Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALLDQ8WX93 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms