Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD1Q8NHV4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms