Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC71LQ8N9Z2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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