Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC155Q8N6L0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms