Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRBD1Q8N5C6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRBD1Q8N5C6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms