Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAG2Q8N3U4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms