Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC50Q8IVM0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC50Q8IVM0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms