Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB11FIP4Q86YS3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11FIP4Q86YS3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms