Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNMA8AQ86V59 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA8AQ86V59 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms