Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HAPLN4Q86UW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms