Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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