Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms