Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG9AQ7Z3C6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms