Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms