Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CFAP47Q6ZTR5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP47Q6ZTR5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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