Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms