Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRSAM1Q6UWE0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms