Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC171Q6TFL3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms