Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD2Q6P5Q4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD2Q6P5Q4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms