Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD54Q6NXT1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms