Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG9BQ674R7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms