Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPRD2Q5VT52 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPRD2Q5VT52 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms