Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM78BQ5VT40 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM78BQ5VT40 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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