Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RSPH4AQ5TD94 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RSPH4AQ5TD94 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms