Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP188Q5SRE5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP188Q5SRE5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms