Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFHC1Q5JVL4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms