Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCID2Q5JVF3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCID2Q5JVF3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms