Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL39P5Q59GN2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P5Q59GN2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms