Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDCA8Q53HL2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms